看板Biology
标 题[问题] 蛙类mtDNA中16SrRNA 的二级结构
发信站吟风‧眺月‧擎天岗 (Tue Apr 1 15:20:51 2008)
转信站ptt!ctu-reader!news.nctu!BBS of NCUE BioDept
在一般动物的分子监定上
常采用12S和16S rRNA的保守序列作为工具
可是在16S rRNA中会因为二级结构摺叠所以
使序列分析出不精确
因为我想分析的序列物种
从未剪辑过的12S和16S rRNA就可以看出差异
不过有朋友建议我需要编辑他们的二极结构
将发夹区去除再重新比对
这样资料比较准确
只是我想问
1.蛙类来说有剪辑过後的基因序列差异一般会影响多少？
2.有没有摺叠16S rRNA免费软体可以下载？for windos的？
--
莫 何 竹 谁 一 料 微 山 回 归 也
听 妨 杖 怕 蓑 峭 冷 头 首 去 无
穿 吟 芒 ？ 烟 春 斜 向 风 ｌ
林 啸 鞋 雨 风 照 来 雨 苏
打 且 轻 任 吹 却 萧 也 轼 定
叶 徐 胜 平 酒 相 瑟 无 风
声 行 马 生 醒 迎 处 晴 波
--
→↓ O
rigin:
彰化师大生物系˙吟风‧眺月‧擎天岗 micro.bio.ncue.edu.tw
↑← Au
thor:
bad 从
210.60.163.124 发表