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标 题Re: 请问有关PCR的问题
发信站不良牛牧场 (Wed Mar 21 23:34:12 2007)
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※ 引述《[email protected] (uranff)》之铭言:
: 现在我想要做一个3kb左右的PCR
: 由於之後要接着做cloning,所以比较要求准确性
: 先前试过的几个PCR酵素搭配模式:
: pfu DNA polymerase (Promega) only (0.6U in 25ul)(使用期限仅到今年五月)
: Blend Taq DNA polymerase (Toyobo) only (0.5U in 25ul)
: Viogene Taq DNA polymerase (5U in 25ul) + pfu (同前) (0.6U in 25ul)
: (用这种搭配模式的原因是因为有看过paper利用pfu专责做更正)
: 使用的template:cDNA (以random primers做RT)
: condition:95℃ 5min
: 95℃ 1min
: 69℃ 1min (35 cycles)
黏合温度太高
可以试着降低一点
我不知道你的incert是有做什麽处里(修饰还怎样的)
但是以我做cloning的小小经验
温度降到58度都可以做出来
还有一般来说
我做pcr若片段长度超过800bp我才会调成1min
不然一般elongation的时间都大致在30-40秒上下
你可以试着调整自己的protocol看看
pcr会夹不出来
除了你忘记加temple.dNTP之外(真的会忘记加 XD)
最重要的就是引子黏合的温度了
: 72℃ 7min
: 72℃ 15min
: (另外,第一组用pfu的在denature及anneal都拉长到3min,後来听同事意见改短)
: 结果只有第一组pfu only有跑出一条700bp左右的band,其他两组完全跑不出来
: 这样子的话,我要从哪一方面着手改,才能够跑得出来呢?
: 我一个同学有跟我说过,他们那边用Merck的pfu DNA polymerase,可以很轻松的跑到12kb
: 难道真的要换Taq来做才做的出来吗?
: 谢谢
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