O Ca : alpha碳 打不出来... | Ca- C - N - Ca ↑ | ↑ psi H phi peptide的基本架构如上，两个aa之间由peptide bond形成，有个很重要的特性是peptide bond是不可以旋转的，但是alpha碳上面的两个phi bond跟psi bond可以360度旋转，因为 aa的特性不同所以使旋转的角度也有所不同才能够形成不一样的secondary structure， 例如说在alpha helix的结构下，phi角度约-45~-50度，psi角度约为-60度，从这个课本 上的例子来看，这两个角度并不会相同，其实也因为有这两个角度的不同才让分子有够 自由的空间能够形成更多种folding。 CD我印象中是测定二级结构最好最方便的一种方法，原理大概是类似把peptide丢进去， 利用分子旋光性的不同可以跑出一定的波长跟吸光度的图谱，alpha helix、beta sheet及 random coil会有不一样的图谱，一眼就可以看出peptide是属於哪种结构。 其中的random coil就是除了常见的helix、sheet以外的第三种没有规律的结构，就是 peptide是随意缠绕没有规律的，应该就是你所要问的random conformation。所以你读到 的资料可能是告诉你random coil这种二级结构在210-220nm的波长间会有最大的吸光值这 个特性。 ※ 引述《zinga (zinga)》之铭言： : 请问一下 secondary structure 的 phi角 和 psi角 都是相等的吗?? : 还有Random conformation 和 Circular dichroism spectrum exhibits : a maximum in the 210-220nm 有甚麽关系?? : Random conformation 又是甚麽?? : 恳请高手解答 thx!! --

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