作者sunnysky7 (sunnysky)
看板Biology
标题Re: [问题] 生物化学
时间Wed Nov 15 03:38:08 2006
O Ca : alpha碳 打不出来...
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Ca- C - N - Ca
↑ | ↑
psi H phi
peptide的基本架构如上,两个aa之间由peptide bond形成,有个很重要的特性是peptide
bond是不可以旋转的,但是alpha碳上面的两个phi bond跟psi bond可以360度旋转,因为
aa的特性不同所以使旋转的角度也有所不同才能够形成不一样的secondary structure,
例如说在alpha helix的结构下,phi角度约-45~-50度,psi角度约为-60度,从这个课本
上的例子来看,这两个角度并不会相同,其实也因为有这两个角度的不同才让分子有够
自由的空间能够形成更多种folding。
CD我印象中是测定二级结构最好最方便的一种方法,原理大概是类似把peptide丢进去,
利用分子旋光性的不同可以跑出一定的波长跟吸光度的图谱,alpha helix、beta sheet及
random coil会有不一样的图谱,一眼就可以看出peptide是属於哪种结构。
其中的random coil就是除了常见的helix、sheet以外的第三种没有规律的结构,就是
peptide是随意缠绕没有规律的,应该就是你所要问的random conformation。所以你读到
的资料可能是告诉你random coil这种二级结构在210-220nm的波长间会有最大的吸光值这
个特性。
※ 引述《zinga (zinga)》之铭言:
: 请问一下 secondary structure 的 phi角 和 psi角 都是相等的吗??
: 还有Random conformation 和 Circular dichroism spectrum exhibits
: a maximum in the 210-220nm 有甚麽关系??
: Random conformation 又是甚麽??
: 恳请高手解答 thx!!
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