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标 题Re: [问题] App gene的promoter
发信站木棉树 (Sun Sep 24 02:27:32 2006)
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※ 引述《[email protected] (NN )》之铭言：
> 请问有人知道如何找到house mouse的app gene的promoter
> 我ncbi网站翻遍就是指看到mRNA和gene,完全没有promoter的sequence
> 所以请各位高手帮帮忙!!
> 谢谢!
> ----------------
> 不然告诉我怎麽找promoter也行,但不是找人类的!
找paper应该是唯一出路了
promoter region只能理论预测,必须要实验证实才比较可信
找文献中最常用的region最保险
若真的都找不到,就自己clone自己试试看罗
要clone的话,要找到transcription initiating site
(参照有人做过的RACE data应该找得到)
初始设计的primer最好能夹出从-1.5k~~+200bp区域
长一点较好,再慢慢narrow down出专一区域
挺麻烦的,但不做也不行啦
若一开始clone太小段的话,很容易miss掉一些重要区域且不够客观
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