作者wawas (30 KD)
看板Biology
标题请问一个我实验上遇到的问题~protein的expression
时间Tue Mar 21 01:33:50 2006
我的实验是做Wnt pathway
简单的说~就是想办法让Wnt pathway on or off
然後去看他的下游gene的expression
目前为止~activate Wnt pathway都没有问题
有问题的是inhibit
我使用的材料是dnTCF
TCF是Wnt pathway下游的一个transcription repressor
这个construct是跟别的实验室要的
问题来了
在test的时候就发现我的dnTCF不work
於是就做了transfection跑western看他protein有没有表现
跟wild type比较的结果
western几乎没有表现~(意思就是wtTCF表现很多)
这当中老师怀疑是我transfection的问题
於是我co-transfect了GFP当作internal control
在照相的时候发现GFP的亮度有变
老师又怀疑是我照相的问题
於是我心一横
又做了一次co-transfection with GFP
分别拿去跑flow和做IF
发现其实transfection efficiency都差不多
可是在wtTCF和dnTCF中
GFP的萤光减弱很多(无论是flow或是IF都是这样的结果)
而在IF的结果中
dnTCF几乎没有表现
所以问题有几个
1.到底为什麽我的dnTCF不会表现??
我要到的construct是delete掉N-terminal 93个amino acid
而我查paper一般用的dnTCF的construct是delete N-terminal 31或33个amino acid
但是我去查了TCF的 structure
即使delete掉前面93个amino acid应该是不会影响他的function才对
所以我一直不知道为什麽我的dnTCF不表现
2.在wtTCF中看到GFP的萤光亮度减弱是可以理解的
因为TCF是transcription repressor
有可能因此抑制了GFP的表现
重点就在於~这个现象在dnTCF里面也有看到!
如果dnTCF不会表现,它怎麽去影响GFP的expression??
(我有做另一个control是transfect plasmid 的backbone但没有任何gene
发现GFP的expression很亮~所以wtTCF和dnTCF相较之下变弱很多)
请版上高手帮忙解答吧
我已经搞这个搞了很久
弄得很挫折
希望大家可以一起讨论~
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◆ From: 140.109.4.195
1F:推 shaline:建议你先确定作western时用的anti-TCF Ab的epitope是否 03/21 13:59
2F:→ shaline:落在N端delection的位置;再者,dnTCF可能有表现,或许有 03/21 14:01
3F:→ shaline:function,但也会造成wtTCF dominant negative,导致TCF 03/21 14:04
4F:→ shaline:在western中无法被detect到。 03/21 14:05