作者Liebesleid (recursive I love you)
看板Bioindustry
标题Re: [问题] 请问R软体在CRO有发展可能吗?
时间Thu Feb 23 08:32:21 2017
※ 引述《parcequetoi (Sky)》之铭言:
: 爬文之後想请教的问题有二:
: (1) R语言在CRO有可能(渐渐)取代SAS吗?
: (我能找到最近关於此议题的讨论是前年的文章了)
: 虽然对临床试验领域是有兴趣的,
: 但要放弃自己已经学到一定程度的语言毕竟还是有点不舍,
: 而且担心如果後来没要在CRO久留,
: SAS这项技能发展有限,因为以SAS为需求的工作并不多。
我想想,因为 CRO (或任何一个药厂) 的 statistician 都不太可能是一个人独立作业
还满多是一起 co-work 的
可能要考虑到的点是,如果你的同事都是用 SAS,你一个人用 R 会不会有不顺的地方
而且以前就是用 SAS,有留下很多 SAS 的 module,所以用 SAS 处理是最快的 XD
(认真的 data management 步骤其实很复杂喔,不是一个人可以独立完成的
从 statistic plan 撰写之後,还要做 mock database 然後 programmer 写程式
而且可能还会不只一个人写不只一套因为要做一些 independent validation 之类的
倒假资料比对一次比对两次不停修正之後,才会有正式版的东西出来)
另外方面还要考虑到和原有的 database 相容性的问题
虽然以我非常浅显的对资料库的概念来说,我觉得应该不是很大的问题
反正不管用什麽资料库,大概都是把 data dump 出来以後倒到程式里运算
罢特那可能也只是常见的 SQL 那个系列,但临床试验很多都是 oracle database
(因 FDA 认证之关系,我不知道像 MySQL 这种有没有认证过)
中间的串接就会是个问题
(刚刚大致查了一下,有套件可以串所以应该没问题)
最後,也是前面有捧友提过的 R language 是不是有通过 FDA (validation)
这点是我觉得最微妙的地方,因为刚刚查了一些文件 (包括 R foundation 出的)
他的大意是,R 语言本身是可以满足 FDA validation 的要求
但是因为你知道的 R 语言只是一个语言,但在 data management 的每一个步骤中
用的每一项东西,都要符合 FDA validation 的要求
我觉得这可能是 R 比较弱势的地方,因为他本来就是个开源软体
没有像 SAS 一样有这麽大的公司 support,可以一整套都弄好再给你一个 certificate
这可能也是一般 CRO 的 concern
(大到可以开发自己的开发环境和 database 的 CRO 我相信没几个)
至於 SAS 是不是那麽黄昏,我不觉得耶
老实说 R 可以做的事,SAS 应该是没有做不到的
不要太神话 R,他就只是一个统计处理软体而已,最大的好处是不要钱 XD
在一些 data mining 的工作上,因为不需要太厉害的 validation 机制
所以可能用 R + 一些套件是 ok 的
但临床试验的要求就多如牛毛,所以我觉得会有不同的 concern 吧
几年以後 R 会不会取代 SAS?
我个人是觉得总有一天会,等到所有的开发环境都成熟时
但你说只会 SAS 的人会不会找不到工作?我到是不这麽想…
: (2) CRO statistical programmer月薪通常是在什麽范围呢?
: 55K甚至60K以上有可能吗?
: 这问题纯粹就只是在挣扎要不要为五斗米折腰...
: 谢谢大家!
不知道 XD 但需要 data analysis 的公司不只 CRO 啊
不要太限制自己的路惹 XD
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想当年我研究所时做 data mining 还在用 perl+SAS 在 linux 下跑呢哈哈
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 123.193.12.184
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※ 编辑: Liebesleid (123.193.12.184), 02/23/2017 08:42:00
2F:→ cisbpmtw: google R FDA SAS, 可以找到一些说明 02/23 08:55
3F:→ Liebesleid: 我说R语言本身ok但是其他配合的东西他们不能保证 02/23 08:58
4F:→ Liebesleid: 这也是R的官方文件里有强调的,有被认证的 library也 02/23 08:59
5F:→ Liebesleid: 有说明 02/23 08:59
6F:推 wintercoldb: 本篇专业! 是同行吧? 02/23 13:53
7F:推 windrain0317: 基本上code不会只有一个人写来爽 02/23 15:09
8F:推 parcequetoi: 谢谢这篇的分享! :D 02/23 23:20
9F:→ parcequetoi: 可能因为我对SAS比起R真的太不了解,我反而觉得SAS可 02/23 23:22
10F:→ parcequetoi: 以做到的事,R没有做不到的...(被打脸中) XD 02/23 23:25
11F:→ parcequetoi: 对我来说R吸引我正是因为它是开源软体,没有人做到的 02/23 23:28
12F:→ parcequetoi: ,我们自己挑战来写一个,这才是我喜欢的地方~ 02/23 23:30
13F:→ parcequetoi: 另外R markdown、shiny、plotly等套件也让资料呈现的 02/23 23:32
14F:→ parcequetoi: 即时性和互动性都大增,原本想CRO的报表也会增色许多 02/23 23:37
15F:→ parcequetoi: ,不过看起来还是有许多其它限制的... 02/23 23:38
16F:推 LRose: 感谢分享! 02/24 00:03