复方的问题,我觉得可以这样来讨论,如果compound[1] 结合到 binding site [1] 後,整体结构(protein+compound)可能改变,这时binding site [2]可能改变结构,原本设计的compound[2]就无法结合入原本binding site [2],那是不是空谈…..我想到的方法是compound[1] 结合到 binding site [1] 後,整体结构(protein+compound)先结晶打x-ray确定binding site [2]有无改变,再往下做,还要考虑binding环境 另外binding环境的问题,虽然是模拟体内的环境,但是是套用protein的x-ray结晶构型,要如何确定protein在体内的环境变成什麽构型才是重要……. 举个例子…如果protein结晶时会露出active site,但在体内的环境时因构型改变, active site给一个amino acid盖住了….那你怎麽算都不会正确…. 电脑模拟我想是药物开发的工具之ㄧ,至於能够利用到什麽程度就看拟真度高不高了…. ※ 引述《piimaila (肥仔)》之铭言： : 稍微整理一下目前讨论结果 : 如果想要厂商接受 : 电脑实现高通量筛选要可行必须有 : 1. 配体(化合物, 药物)够多, 也就是目标应该定在 缩小传统HT的范围. : 2. 由於目标是1 所以速度必须远高於厂商能够取得的HT机器之速度. : 3. 由於是缩小传统HT的范围故价格要低於缩小HT范围所得到的价格效益 : 但是, 如果另一方向想, : 如果 能找到一个各方人才的团队(主要是生技, 资讯人员) : 开发出目前市面上疑难杂症的药物, 该症目前可能宣称为不治之症或慢性病 : 当然, 不可能是治癒, 但是理论上可以控制. : 举例说明: 红斑性狼疮, 第二型糖尿病, 痰湿型肥胖症 : 该药物群"仅"通过电脑筛选. 这样, 这些资料是否有市场呢? : ※ 引述《s122s91 (lo)》之铭言： : : 如果你用现在上市的药, : : 用电脑模拟去算,分数一定不是最高的 : : 如果把电脑设定成"上市药物"为最高分的参数,拿来跑,设计出来的药物,活性通常不高 : : 我想这就是困境。 : : 不知道到现在为止,有没有药物是真的由模拟出来的。 : : 电脑模拟就是模拟,不一定准。 --

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