作者starginger (英文疲劳轰炸中)
看板Bioindustry
标题Re: [问题] 关於real-time PCR的问题
时间Wed Mar 26 19:40:45 2008
我以前是做RT-real time PCR
也是用SYBR Green做的~
我用过PRIMER浓度从100nM~900nM
(每家kit建议的浓度不太依样)
个人觉得浓度越高primer dimer比较严重
有时连negative control也会有讯号
我不太喜欢这样的DATA
在我的实验中
降低primer浓度只是会让终产物变少
对过threshold的Ct并没有影响
不过还是建议每次跑realtime都要放positive/negative control
※ 引述《frela (漫步北台湾)》之铭言:
: 您好,我是某公司的产品专员,
: 根据敝公司的SYBR Green supermix KIT标准操作手册中指出,
: primer的终浓度一般最好是介於100~500 nM 左右
: 而您文中之意是贵老师认为最好终浓度在500 nM
: 而您"不小心"只用了终浓度50 nM
: 基本上,若不考虑不同产品的优劣性...
: 您用的量,"会不会太少?"
: 这个问题...我想很少人可以回答,因为不同的检体或样本
: 都有可能有其最佳的条件存在,primer也是一个需要考量的条件,
: (比如说primer 的浓度低,是可以有效降低primer dimer的问题...
: 不过这是不得已的解决办法...)
: 关键在於一般像QPCR这种相当敏感的实验来说..
: 您的positive control及negative control能不能有效证明您的实验是合理的,
: 才是重点!
: 如果之前没有设定的话
: 您就重新各设定一个positive control及negative control来证明...
: 若依我不负责任的说法...我倒觉得根本没差多少,只是最低浓度的二分之一?
: 论文中明确着明方法即可...
: ※ 引述《candy315 (沉淀)》之铭言:
: : 各位大大好,我是某大学的硕士生
: : 我想请教关於real-time PCR的问题
: : 大部份的实验...都会用RNA转cDNA然後再做real-time PCR
: : 但我的template是genomic DNA
: : 也有听说genomic DNA的real-time比较不好做..
: : 然後,一个大问题来了
: : 我们老板说,primer的量通常是总体积的1/10左右
: : 所以我先用一般PCR在测试primer时,我是用5uM的primer,然後每管取2.5ul
: : (total volumn为25ul)
: : 但做real-time时,因为我阴错阳差的失误
: : 一直以来,我都是用5um的primer,然後每管加0.25ul
: : (total volumn亦为25ul)
: : 我想请问大家,有人用过这麽少量的primer吗??
: : 因为我的实验其实已经快结束了...如果我之前的primer量真的加的太少,
: : 那我可能所有实验要重做了....orz
: : 所以我想请问各位有经验的大大,有人也是和我一样,用类似的量做real-time PCR的吗
: : PS,我用的kit是 SYBR的kit
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