大学指考开始了 我举补习班当例子 如果一个补习班有2万5千名考生(25000个基因) 经过一堆模拟考後 补习班为了赚钱再推出精英班 说只要模拟考总平均在前50名的可再几万元 进精英班拼1个月 保证考取台清交 考试结果果然这50名都进台清交.. 补习班就大幅宣传"精英班之优点" 我只听过课 不像sherylcrow或其他2位对microarray有专业知识 但我想到的是以前硕士班训练之下给我的逻辑推理关系 精英班这50名 如何产生的? 参考之前几次模拟考成绩 所以你再给他们模拟考 甚至於大学指考 他们依旧是优秀 (array上要检测那些基因 是依据已发表的众多papers之研究结果 你再用任何方法去研究 这些基因都还是会跟所指出的癌症疾病有关) 然而"要精英班才会考上台清交吗? 考上是精英班的贡献吗?" 上面2问题在逻辑推理上都是有问题的 考上台清交的也有一直表现平平 没能进精英班 但最後靠自己而获胜的 同样的 目前还没有被发现的基因作用 也许亦会影响某癌症或其他疾病 这些基因在目前是没有papers去证实他 但没有人敢拍胸脯说不存在 所以拿array的检测结果只能说 以目前科技检测下此受检者是否有某癌症 但在未知知识下 无法100%说 受检者有没带有某尚未被发现或证实致癌基因 或某个尚未被发现或证实的致癌基因是否已经在表现 目前许多癌症生化检测 靠的是蛋白 在基因层次还只是学术研究离临床还有距离 所以目前有蛋白质晶片的热门兴起 以上我是站在若某一天我成了受检者 我所疑虑的 我目前宁可用传统生化检测还比较可靠 array data 说有癌症 只是乌龙算是还好 顶多受惊了 但若说没癌症 但其实是有 而没检测出来 那将会是一条生命的误诊 在统计归纳上 也许将来array能分析到80%的可信度 但也表示有20%的误诊 这对关系到生命的检测而言是需要去改善的 而20%误诊中 却可能包含了 一些未知的基因机制(未选入精英班的学生) 这部份是最大盲点 且无法由目前的microarray领域去改善它 只能消极等待学界对癌症的更深入了解 ※ 引述《sherylcrow (鲈鳗阿德)》之铭言： : 我不太清楚coyot前辈的意思,[还是相互参考而成的,若是参考而成 拿"成"再反证 : 当然有如老王卖瓜罗].不过我想你应该了解QPCR是什麽东西. : 做分子实验的,非常注重实验的反证,就连microarray内部都会有control点,microarray : 实验是否成功,会由control来反应,QPCR内部也会有control gene.不论做什麽实验都会 : 有control,主要是来反证你data 的可信度. : 现在microarray 的 paper,大多都会再做QPCR or northern blot,来证明array data : 的可信度. : 目前检测肝癌,最具代表性的gene是AFP,但并不是每个得肝癌的病人会有表现. : 但它却在临床检验上使用很久了. : 牺牲...真抱歉我没表达清楚,我指的牺牲不是病人,而是要有人去开发array : 去牺牲,才会去改良. : ※ 引述《nightcatman (夜猫)》之铭言： : : 唔...好神... : 新加坡的Limsoon Wong使用affy做血癌...就近三百片了 : 史丹佛大学,做array是最有名了,光是肝癌就二百多片了 : : 可以请问一下你在算R值的时候有算进一大堆低表现量的基因吗? : 我们有cutoff的标准,R值只是看Raw data的线性相关,事後还有做normalization. : : 那可能就是高R值的来源... : : 另外以u133 plus2而言 : : 其稳定性仍旧是学术研究的等级 : : 他的规格书里也有写明 : : "For research use only. Not for use in diagnostic procedures." : 嗯..是没错,你应该也有看到这段话. : The GeneChip Human Genome Arrays provide gene expression data for : a multitude of applications, including: : · Uncovering new regulatory pathways : · Validating drug targets : · Clarifying diseases : · Analyzing toxicological responses : · Building robust databases : : 就是因为临床医疗上所要求的稳定性标准比学术研究要高得多 : : 你最後说的"选出具代表性的基因"确实是重点 : : 像u133 plus2这麽多点的array,相对上来讲稳定性就比较低 (还好它是Oligo) : affy设计probe有PM与MM,来计算点的可信度,以及intensity. : : 那只是在研究初期乱枪打鸟用的 : 呵....是没错...不过国外已经打了很多只鸟了... : : 如果可以透过一连串大规模的实验 : : 确实的针对某种疾病找到可靠的marker,并藉此缩减点数 : : 稳定性就会提高许多 : : 价格也才有可能cost down : : Anyway, 如同我想表达的,这些都还只是未来的愿景 : : 做学术研究ok : : 但在临床医疗上还是保守一点的好 : 目前学术到临床是有段距离,严谨是一定要的. : 目前政府某单位,正计划将microarray运用在动物疾病检验上. --

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