作者mcasp (stanley)
看板Bioindustry
标题Re: 系统生物学与代谢工程
时间Wed Jun 29 00:29:01 2005
很感谢,前辈您许多comment
※ 引述《nightcatman (夜猫)》之铭言:
: 跨领域整合沟通的确很重要
: 不过知道要做整合是一回事,真正在做整合又是另一回事
: 我在这个领域试着做整合也很久了
: 真的是很困难
: : 举例好了,日本在systems biology找出几个现行antifugal drug
: : 几个上游target,而且是药厂出资的study ,不是像台湾
: : 学术界教授、只会骗国科会、国卫院钱来生SCI paper
: : http://sbbs05.lifescience.ntu.edu.tw/index.html
: : 详见东京大学 基因体研究中心副所长 Miyano
: Miyano最近一次带团队到台湾来开研讨会
: 我在台下问到他们的PI当场承认投影片里的东西只是"规画"而不是"成果"
: 这样您了解我的程度了吗?
: 也许有些版友看到这里就可以猜出我的身份了 :)
我应该说清楚的是 单指运用systems biology
anti-fungal drug griseofulvin 这一块
他们说 做出一些上下游的druggable genes 是让人觉得很promising
也是可能以後药厂可以用的模式
或是以後在endothelial cell可行的模式
或是现在Lilly在Singapore的 Systems biology Lab到底在弄些什麽???
您说的endothelial cell modelling这部分吗?是规划中吗?如果还没做,那也不意外,
但是去看 beyond systems biology 2005 中 也是几家美国公司
布局进入这一块了
或是Miyano 的collaborator 在Cambridge uni, UK 的 Cristin Print
在 beyond systems biology 2005 中 ,有一些报告,但不晓得,做的如何??
: 国外对此的投资和认知确实比国内进步一大截
: 但,认知是认知,成果是成果
: 不管他们投了多少钱,目前也并没有可靠的成果出来,这才是重点
: 整个systems biology目前根本就还在累积data的阶段而已
这就我的论点,我觉得您对bioinformatics/ systems biology
都太悲观了,不过这是就业上的事实, 但不是产品上的事实
事实上,在bioinformatics/ systems biology这条tract 上
台湾 最大的问题是 大概很少有人从 math/EE/CSIE/ 念了 bioinformatics
後,再投身到 bioengineenging , biotech 上, 甚至来回答临床上、医药上的问题
与需求
国内跟国外最大的不同是
我觉得 像跟过 Leroy Hood. 的 Trey G. Ideker 他从 MIT 的EECS 一路从
BS念到master 然後到 University of Washington 念 Ph.D. in
Molecular Biotechnology ,至少帐面上他手下还有人或是collaborator做
wet lab 可是,反观台湾, 有多少人这样??
: : 而做bio的想做modeling 又不知道从何入手。
: : 而且台湾很大比例做bio的人通常数学、物理不是很好
: : 目前中研院基因体研究中心,设有translational research/育成中心
: : 都是好的开始
: 您所说的modeling的确是重点,您能看到这一点就很不容易了
: 已经比国内一些短视的PI要好很多了
: 不过呢...中研院基因体研究中心内部根本不重视modeling,您知道吗?
感谢听到前辈您的论点。
: 台湾也的确落後国外一大截
: 但是,我要说的是,国外的东西也没有您说的那麽美好
可是,看看现在台湾做了什麽?各做各的
台湾的悲哀
: 是实上很多东西都是有问题的
: 在这个field里面,因为东西太新,所以有很多都是在唬烂不懂的人的
: 国内国外都一样
: 就像Miyano的例子那样
: 如果您在那个研讨会,大概会完全相信他的投影片吧... :)
: 所以我还是认为,如果您不是真的很了解技术性细节,而只是个user的
我觉得趋势、方向、会比 细部技术 重要的多
大家都同意,这中间,有太多细部细节 ,但是这些细部细节会一直改进
所以说,我觉得这不是神话,只是一个快完成的进行曲?
我觉得跟在leroy Hood 肩膀後面看事情,以他的发明、经验、资历
这个方向,这个应用是不会错的,
我自己也不是stupid user ,我至少也用过一些 SELDI-TOF, MALDI-TOF
proteomics加上 machine learning去骗骗人,
所以以後我会多注意前辈您的提醒。
: 您可以再低调保守一些
: 因为实际上,您可能连别人唬烂您的地方在哪里都看不出来
: 所以才会对国外的东西有太多不切实际的信任
其实,我觉得我还不是老师,虽然有上一些医学生的实验课
所以,我大概多是多讲话,或许有些内幕不了解,想信
透够这样的讨论,可以得到更多东西。
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