作者nightcatman (夜猫)
看板Bioindustry
标题Re: 请教 目前大家对bioinformatics的看法
时间Wed Jun 29 00:34:50 2005
我也很高兴您对microarray有如此高的信心
我只是想提醒您,目前还没有那麽好
您如果是临床医师,对这种东西用起来应该要更加小心
病人的生命掌握在您手里
※ 引述《mcasp (stanley)》之铭言:
: 一直高兴听到您不同观点和论点
: ※ 引述《nightcatman (夜猫)》之铭言:
: : 但终究您还是个user
: : 对於microarray从设计阶段开始一直到最後结果出来
: : 其间的不稳定性您了解吗?
: : 如果您了解,我相当怀疑您怎会对目前的microarray有如此强烈的信心
: everybody know that
: well documented in Nature 2004 oct 22
: getting the noise of gene arrays
: also in NAR 2003 p5676
: even lots of difference if you are using LMD techology
这两篇不就更证明了repeat实验的重要性吗?
repeat = money = cannot cost down
这就是问题所在啊
: : trial就表示还不确定
: : 参与trial的人早就了解风险并愿意承担此风险,ELSI文件也不是签假的
: : 所以并不表示风险不存在
: currently at level 3 evidence base medicine
: soon may becoming level 2 level 1 EBM
: you also read some comment form JNCI
yes "CURRENTLY" at level 3, that's the point
: : 您说国内抓不到重点,内斗,都是事实没错
: : 但是您何以对国外产品就可以抱以如此高的信心?
: : 我的point就在这里,因为你是user
: : 你看到国外产品的漂亮数据就觉得他们成功了
: : "国外"两字又增强了你的
: : 但是以技术人员的观点看来,这些产品都不够稳定
: 要批评不稳定如何、如何,大家都会,
: 但是以荷兰这样的小国
: 一连从Nature, NEJM的文章,一路可以translational
: 到一家像样公司,我觉得是台湾人先低下身来的反省的时候
要开公司推产品,事实上没您想像中的难
有人愿意出钱+有人敢推出不知道能不能用的产品+有人会被广告数据骗
就可以了
我觉得台湾当然要反省,但外国的月亮也没有您想像的圆
: : 敢用这些产品只作一次就当做临床诊断依据的医生,不是太勇敢就是太无知
: 您这句话,就点出我所谓的产业与业界的差异
: 病理医生只要用最古老H&E stain 就可以诊断90%的乳癌
: 目前临床上、需要的是 可以算出预後的因子
呵,我所谓的"诊断"当然是指分出class
不然用microarray干嘛?
: 目前是IHC可以用,但是 随便用microraay , HR 是4x 到5x
我还是那句话,你做几次repeat?
在真正的case上做到可靠的数字需要多少次repeat?
做这麽多次的repeat要多少钱? 花这麽多钱的东西有多少病人会用?
您敢单单以microarray的结果做出预後处置,还是综合IHC结果互相对照?
还有marker问题,我说过了,乳癌算是已经有定论的特例
并非所有疾病目前都有marker可用
: 大家都知道现行array的一些问题
: 但是在2002年 我还是实习医师 intern时,偶尔看到Nature这篇文章
: 我也想说只是篇SCI 很高的文章。 那时这个study patient 是约70人
: 後来他把病人 extend 到 230?人,登在NEJM
: 到了2004 在去看,居然已经变成一家公司, scale 大到上万
: inclule 到一些 Harvard, MGH 的病人。
: 所以我想,这些医院的医师也不是太无知或是勇敢,
2002年我就已经在microarray和bioinfomatics的领域打滚好几年了
我说过了,只要有钱投入+有人愿意试
实验规模自然就能扩大
但这并不表示它在技术上就真的很稳定
: : 台湾是在生paper的阶段没错
: : 但是以严谨的观点来看,目前全世界都只在生paper的阶段而已
: : 国外有产品上市,那是他们有钱搞个看起来很棒的东西出来,而且敢拿出来上市
: : 只要放一些"最佳情况"的数据上去
: : 就是会有一些具有莫名强烈信心的客户来当白老鼠
: : 另外,在您还不知道我的背景来历之前
: : 就讲些什麽"暴露了台湾长久以来的文化"的东西
: : 您会不会觉得太自大了点?
: : 您何以认为我不在产业界?
: 不管您是来自产界还是业界,其实您的观点本人不是很认同
: 反正,台湾是学界做学界的,产界做产界的
: 反正产界R&D钱也不多,也一直捉不住方向、临床需要
: 然後大家没做出什麽来,再怪罪到台湾市场小、
: 基础科研不够、XXXXXX
台湾市场小,基础科研不够,是事实
产界R&D钱不多,一直捉不住方向和临床需要,也是事实
但不知您想表达的是什麽?
台湾现在做得很烂,大家都知道
但是国外做的就真的如同您讲的那麽好?
您真有足够的专业知识去判定国外的成果好坏?
还是只看到国外砸了大钱组了大团队开了大公司推出了产品
就觉得他们已经做出了很棒的成果?
这才是我想表达的
: 不过,我想大家是高兴听到这样的讨论
我只是想请您保守一点,别冲太快
尤其您又是个临床医师
理论上您应该比我们这些技术人员要更加保守小心才对 :)
病人的生命掌握在您手里
: : 在我看来,您才是真正不在这个产业里的人,您只是个user
: : 您果然不在行内
: : 基因体研究中心就是目前内斗核心及问题所在
: : 不过在bbs不能讲太多
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