作者dontsteal896 (violence阿公)
看板BioMedInfo
标题[问题]rnaseq分析 基因表现量算法
时间Fri Apr 1 00:57:04 2022
如题
大家好
朋友在做rnaseq後
在分析完基因表现量再去找有显差基因的时候
给别人试跑後
跑出来的data的表现量有0
0应该是没有reads吧
但是fold change却可以算出来
想很久看不出来0还会有fold change
想请教大大
并附上excel图
https://i.imgur.com/DmMsbAh.jpg
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 39.8.2.9 (台湾)
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/BioMedInfo/M.1648745826.A.18D.html
1F：推 allqwdd: 这看起来是DESeq2的结果，DESeq2用的是Read counts做 04/05 18:39
2F：→ allqwdd: 计算，不是用FPKM。先跟朋友确认一下他的Input是什麽 04/05 18:39