作者Phaeton (凰呀的鸣叫~)
看板BioMedInfo
标题[工具] 想请问MicroRNA Target Prediction
时间Mon Dec 14 20:42:13 2009
网路上google後 看到几个比较常用的
TargetScan
http://www.targetscan.org/vert_40/
MicroRNA.org
http://www.microrna.org/microrna/home.do
PicTar
http://pictar.mdc-berlin.de/
我自己是用了一些已知的Human cell cycle相关基因去测试
比方说 BRCA1 BUB1B CCNE1 当然还有其他的
可是常常会看到 有database是no results 有的是预测的结果不同
MiR target到mRNA上
我记得是认其3'UTR
可是结果为什麽会有这种差异
总觉得应该要predict出来的microRNA应该会有些许的重复
比方说BUB1B在microRNA.org有let7c 但是TargetScan又没有
请问是我那里的观念有错误?
谢谢
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