※ 引述《adu (^_^)》之铭言： : ※ 引述《windincloud (云淡风轻)》之铭言： : : ^^^^^^^^^^^^ : : 哪样的资料? 从哪边取得? : NCBI 人类的genome : : ^^^^^^^^^^^^^^^^^ : : 这边你指的是? 要将序列转互补嘛? : : 那这样应该是 A <-> T C <-> G吧~ : : 若不是的话 那请不要写 <-> 会让人起误会地~ : 对～是只互补的意思:) : : ^^^^^^^^^^^^^^^^ : : 这边要看特性吧~ 通常是编码区GC高 非编码区不一定 : : 所有资料都是5'写至3' : : 所以当你要丢资料请先确定序列是由5'写至3' : : 至於互补不互补 BLAST 会帮忙判定的~ : 还是没有很了解 : 即便都是5'写到3' DNA以双股的方式存在，那究竟会挑哪一股出来表示？ : 如 http://bioinfo.cs.ccu.edu.tw/wiki/doku.php?id=transcription : 是挑识别股还是模板股？ : 又以genome的资料来说，不同基因，被转录的可能会是双股中其中一股？ : 那在这样的情况下，又会挑哪一股上传到资料库呢？ 由你文中~ 我没有办法知道你想做啥大事~ 不过基本上 序列写法都是由5'写至3' 也就是说你今天不管到哪个地方下载序列下来~ 最左边永远是5'不会变的 至於挑出哪股来表示 我想你应该是想说方向性问题吧~ 在所有的ncbi中的资料都会标上方向性及启始与终止位置 这样你就可以了解这条序列来源是正向或反向股 举例来说~ 我有条阿拉伯芥序列 APG2 http://0rz.tw/ifODr 由Genomic context中可以看到这条是反义股序列 若切换成xml来看 <Seq-interval_from>83259</Seq-interval_from> <Seq-interval_to>85228</Seq-interval_to> <Seq-interval_strand> <Na-strand value="minus"/> </Seq-interval_strand> 一定有以上资讯 在序列部份是在同义股上83259 ~ 85228 方向性为负向 而在提供出来的fasta format的话 那ncbi会很好心的帮你转成5'~ 3' 表示 假定83259 ~ 83268正向股是 atccgtcaat 那fasta给你的不会是正向股序列(因为他写法这样变成3'~5' 不合规定) 所以你看到的fasta >APG2 83268~ 83259 attgacggat 不知以上说明可以让你了解嘛? --

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