作者hgsfhevil (evil)
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标题Re: [程式] 使用R cluster 处理microarray资料
时间Wed May 13 20:57:51 2009
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=hgsfhevil&b=2&f=1516295336&p=0
我放在这里面,不过他把我缩图了
我主要是把中间那快移除掉,我只要是看他clust什麽
不是看那花花绿绿的东西
※ 引述《hgsfhevil (evil)》之铭言：
: ※ 引述《hermeslu (左慈)》之铭言：
: : 想问大家一个问题，
: : 我的状况是资料比数太大，
: : 使用hclust，将资料as.dendrogram，再str看结果，
: : 可是资料太大即使卷轴在最高，
: : 分群结果还是无法从头开始。
: : plot更惨，完全挤在一起，根本看不出结果。
: : 图片
: : http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/756.page
: : 想问版友：
: : 1. 有没有指令可以将分群结果输出成 .txt ？
: : 2. 或者其他分群package有包含可将分群结果输出的指令？
: : 重点就是 我该如何得到分群结果。
: : 先谢谢大家，等待好消息
: 用Mev去绘图
: 有人知道要怎麽把中间,一大区块的彩色图片移除掉吗,
: 我主要是要看label(row,or gene)的分群
: 这样的作法,根本看不到gene
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◆ From: 140.138.155.182
1F：推 hajimels:你应该是有distanc matrices吧? 用R的hclust可以做你要的 05/14 09:09
2F：→ hajimels:抱歉我突然看到你已经讨论用hclust了...我目前只有想到R 05/14 09:10
3F：→ hgsfhevil:其实我先用R hclust去做啦,而且我也有把图片放大 05/14 13:04
4F：→ hgsfhevil:我像素用2048*2028,如果用原来大小去看,字分的很开 05/14 13:05
5F：→ hgsfhevil:但是用A4格式去印出来的字,还是挤在一起,这纯粹是图形 05/14 13:07
6F：→ hgsfhevil:表示的问题,真的是无解 05/14 13:07