作者hgsfhevil (evil)
看板BioMedInfo
标题Re: [程式] 关於R-cluster的input file 所接受的格式
时间Tue May 5 15:07:11 2009
我已经会使用R-cluster,请问大家,如何让结果输出
以下是我输入的指令,
mydata <- read.table("test.matrix", header=T, sep="\t", row.names=1)
mydata <- na.omit(mydata)
mydata <- scale(mydata)
d <- dist(mydata, method = "euclidean")
myTree_avg <- hclust(d, method="average")
plclust(myTree_avg, hang = 0.1, unit = FALSE, level = FALSE , square = TRUE, labels = NULL, plot. = TRUE, axes = TRUE, frame.plot = FALSE, ann = TRUE, main = "", sub = NULL, ylab = "dissimilarity")
str(as.dendrogram(myTree_avg))<==只有在萤幕上秀出结果,但是我想要输出在档案
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.138.155.193
1F：→ angleevil:png("mygraph.png") 05/10 17:15
2F：→ angleevil:plot(myTree_avg) 05/10 17:16
3F：→ angleevil:dev.off() 05/10 17:16
4F：→ angleevil:我後来才发现,原来我早就做好了,只是我用ssh连到server 05/10 17:17
5F：→ angleevil:但是我没有安装x11,所以我一直看不到图,= =真麻烦 05/10 17:17
6F：→ huggie:从msg应该就可以看出来啦..XD 05/11 07:04
7F：推 seebass:rdesktop是你的最佳选择 =,= 05/12 23:28
8F：→ hgsfhevil:R有windows版本,问题解决了,我当初那个是用ssh连到伺服 05/14 13:15
9F：→ hgsfhevil:当然无法做出图来,现在可以了 05/14 13:15