作者auymle (.....)
看板BioMedInfo
标题Re: [问题] 请问有人知道BLAT这个序列比对browser吗？
时间Fri Apr 3 17:46:41 2009
Query: 你送进去sequence的accession number
Score: alignment後的分数, 考虑到的因素有
match, mismatch, gap, 真正的算法我不太确定
Start: query sequence alignment到的起始位置
End: query sequence alignment到的结束位置
Qsize: 你送进去的序列长度
Identity: 相似度
Chro: hit到的geneome chromosome
Strand: +指的是正股, -指的是反股
Start: hit到的genome sequence的起始位置
End: hit到的genome sequence的结束位置
Span: 也就是(End-Start+1)
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※ 编辑: auymle 来自: 140.129.77.5 (04/03 17:48)