作者windincloud (云淡风轻)
看板BioMedInfo
标题[问题] Basic folding alg. 比对问题
时间Fri Oct 31 14:40:48 2008
今天我利用Basic Folding Algorithm
http://bioinf.kvl.dk/~gorodkin/teach/bioinf2004/talk4_nov5.pdf
想找出一条seq.自我pair的状况
但是今天我在trace back时会有非我要的配对出现
也就是原先我要AT、CG、GT这三种pair
但是出来的结果会有AA或CC CA这样奇怪的配对出现
这样的话 我应该如何处理?
有人有经验嘛?
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ps. 由於我不须要知道是否有branch
所以我把branch判断拿掉
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