作者wscrush (请详细填写个人资料)
看板BioMedInfo
标题[问题]生物晶片资料分析
时间Fri Aug 15 13:59:11 2008
想请问各位板友们有接触过生物晶片资料吗? 我第一次接到这样的题目
因为没有足够的背景知识,加上市面上也找不到"第一次分析生物晶片就上手"
"企鹅也会的生物晶片分析"这类的参考书,让我深感苦手~"~a,还请各位解惑
Q1:我发现很多资料格式中都有Gene Description、Gene Accession Number这两栏
请问这两栏的意义为何?字面上看来我能理解意思是基因的描述与编号,但又看
回资料本身(如下所示),实在难体会其中奥义@.@,加上缩写繁多,不知有类似
缩写的查询方式吗?
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Gene Description Gene Accession Number
AFFX-BioB-5_at (endogenous control) AFFX-BioB-5_at
AFFX-BioB-M_at (endogenous control) AFFX-BioB-M_at
AFFX-BioB-3_at (endogenous control) AFFX-BioB-3_at
AFFX-BioC-5_at (endogenous control) AFFX-BioC-5_at
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Q2:生物晶片的paper会提到,其正规化方式是用log transfrome或是将mean值调整到0
等等...,我想请问网站上所载到的raw data,是已正规化後的吗,亦或是我们要
自己处理?
Q3:如果我想找某个疾病的marker genes或显着gene,我该到哪里找寻?关键字如何下
比较好?同样的基因是否有不同的名称、缩写?
一下子打扰这麽多问题实在很不好意思~也感谢各位版友耐心看完与解答 <(_ _)>
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