作者hgsfhevil (evil)
看板BioMedInfo
标题[问题] 关於blast的用法
时间Wed Jul 2 21:52:47 2008
我知道blast是用来做序列比对的
但是有人知道blast可以用来"去除"序列相似度高的序列吗?
我目前知道cd-hit可以这样做
如果知道的话,可以先告诉我这指命吗?
谢谢大家
ps:看来最近一堆人忙着赶论文,没时间发问了
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 118.169.52.233
2F：→ rebredoxin:你的问题应该是要reduce redundancy 吧！试试看这个 07/03 11:06
3F：→ rebredoxin:网址吧！ Good luck! 07/03 11:07
4F：推 huggie:有啊..assembly的时候可以利用blast找到的序列做masking 07/03 11:43