作者huggie (huggie)
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标题Re: [转录][求救] MASCOT蛋白质身分监定参数设定?
时间Fri Jun 20 21:24:06 2008
※ 引述《muchmoa (...)》之铭言：
: 送到TPP的原因是因为他免费吗？@@"
: 我知道如果有两种以上软体的结果互相对照会比较准确，
: 但通常都不是免费的，
: TPP这东西之前有看过介绍，似乎也是个要凭经验的工具啊，
: 可以麻烦大概介绍一下流程或使用经验吗？
: 谢谢
我虽然身处 proteomics 实验室，但很惭愧的现在才真正要接触，所以还不是
很了解。如果是衔接 Sequest，Sequest只负责 peptide assignment，但并没
有去评估 false positive。一个 peptide assignment 也许看起来很好，但
也可能就是随机就很可能发生的 match，因此TPP就是用统计方法评估。 TPP
分 peptide prophet 跟 protein prophet 部份，细节还不了解。我只知道
peptide prophet 会评估 peptide assignmen 的可能性，然後 protein
prophet 会看一个 protein 有多少 peptide 被侦测到，然後去评估这个
protein 实际上出现的机会。
至於可以提供 Mascot 结果什麽样子的帮助就不是很了解了。
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.160.62
1F：→ huggie:过一个月後应该会比较了解，搞不好可以再补充一下:p 06/20 21:27
2F：推 arpin:卯起来 K 书吧 孩子 06/20 23:12
3F：→ huggie:囧 06/21 11:13
4F：推 plankton:推推~~ XD 楼上被指名要念书了 哈哈哈 06/24 20:14