送到TPP的原因是因为他免费吗？@@" 我知道如果有两种以上软体的结果互相对照会比较准确， 但通常都不是免费的， TPP这东西之前有看过介绍，似乎也是个要凭经验的工具啊， 可以麻烦大概介绍一下流程或使用经验吗？ 谢谢 ※ 引述《NightAmades (夜)》之铭言： : 43... : : 第一 要看你用什麽机器(ms) 这很重要 因为每种机器的解析度 大不相同 : ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ : 这我了解，可是不知道怎样的机器设定又是怎样会较合理!? : 例如中研院蛋白质体服务的机器，送样回来是有建议设定的参数数值! : 可是根据在中研院内的工作人员说...其实所建议的参数也只是针对 : 根据他们所跑的蛋白是经过纯化且量多的情况而设定的!因此这显然并不是 : 一个大家通用的好的参数设定!(个人认为啦~"~) : : 会跟你要设定的tol有关系 当然ms1 tol and ms2 tol会不一样? 这是合理的 : : 可参考http://www.matrixscience.com/help/search_field_help.html#TOL : : 第二 不要选错db 不然没有意义 : : 第三 基本的ptm 要设好例如最基本的 C,M上面的修饰 : : 第四 只有看到mascot上面的结果是不够的 建议将结果转出来 送到 : : CPAS https://www.labkey.org/project/home/begin.view : : TPP http://tools.proteomecenter.org/TPP.php : ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ : 不好意思太孤陋寡闻了~"~ 由於没有用过这两个，可否简单解释一下 : 这程式or软体是用来做什麽的?什麽时候很需要用到它?若不是用它 : 而只是用下述所谓的Excel或人工自己分析...用word统整有何优缺点之处!? : 而所谓的"整合"是指什麽 @"@?? : 感激不尽!^^ : : 去整合 可能会更方便 : : ps最近看到其他学校的学生还在用excel去做蛋白质体的分析 无言!! : : 台湾人要加油了 --

※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc) ◆ From: 140.123.127.45