作者NightAmades (夜)
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标题Re: [转录][求救] MASCOT蛋白质身分监定参数设定?
时间Wed Jun 18 19:02:56 2008
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: 第一 要看你用什麽机器(ms) 这很重要 因为每种机器的解析度 大不相同
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这我了解,可是不知道怎样的机器设定又是怎样会较合理!?
例如中研院蛋白质体服务的机器,送样回来是有建议设定的参数数值!
可是根据在中研院内的工作人员说...其实所建议的参数也只是针对
根据他们所跑的蛋白是经过纯化且量多的情况而设定的!因此这显然并不是
一个大家通用的好的参数设定!(个人认为啦~"~)
: 会跟你要设定的tol有关系 当然ms1 tol and ms2 tol会不一样? 这是合理的
: 可参考http://www.matrixscience.com/help/search_field_help.html#TOL
: 第二 不要选错db 不然没有意义
: 第三 基本的ptm 要设好例如最基本的 C,M上面的修饰
: 第四 只有看到mascot上面的结果是不够的 建议将结果转出来 送到
: CPAS https://www.labkey.org/project/home/begin.view
: TPP http://tools.proteomecenter.org/TPP.php
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不好意思太孤陋寡闻了~"~ 由於没有用过这两个,可否简单解释一下
这程式or软体是用来做什麽的?什麽时候很需要用到它?若不是用它
而只是用下述所谓的Excel或人工自己分析...用word统整有何优缺点之处!?
而所谓的"整合"是指什麽 @"@??
感激不尽!^^
: 去整合 可能会更方便
: ps最近看到其他学校的学生还在用excel去做蛋白质体的分析 无言!!
: 台湾人要加油了
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※ 编辑: NightAmades 来自: 140.127.160.142 (06/18 19:10)