作者hgsfhevil (evil)
看板BioMedInfo
标题Re: [讨论] 预测ESEs的方式
时间Tue Jun 17 11:01:41 2008
...(略)...
: 你既然都可以去得到这些motif
: 你要算这些nt的频率应该没有什麽困难的
: 但我认为这样可能没有办法提供什麽有用的证据
: 我有一些想法你可以参考看看
: 由於目前splice的过程有几个功能比较清楚的protein
: 例如SF2, SC35, SRp40, SRp55等
: 这些protein的ESE matrix已经建立出来了
: 虽然这是在mammalian上的protein
: 我不确定在植物上是否也有类似的机制
: 如果植物上也有类似的机制的话
: 那我们也许可以拿来当作证据
: 你可以先针对你预测到的ESE做cluster<==请问,有什麽软体可以做motif的cluster
...(略)...
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