作者afra33 (豆豆)
看板BioMedInfo
标题Re: [工具] 有没有程式可以从distance matrix作tree
时间Thu Jun 12 14:19:42 2008
※ 引述《fc01 ()》之铭言:
: ※ 引述《afra33 (豆豆)》之铭言:
: : 现在手上已经有distance matrix了
: : 不知道有没有什麽程式可以从distance matrix
: : 去做出phylogeny tree?
: 如果不想花钱的话可以用MEGA4(但是免费软体目前大多数paper还是以phylip为主流)
MEGA4有这个功能欧!
我本来就是使用mega4
可是我没找到这个功能 ><"
请问是在哪边呢?
: 如果愿意花100美金的话.那乾脆去弄一套PAUP....
^^P 话说...这也不一定要有钱才有:P
: : 我试过phylip的 NEIGHBOR
: : 不过...她的结果我觉得有点奇怪,
: 何谓结果奇怪,也许是你有东西设错?
恩 应该是说 ,
因为我不太熟phylip
我直接用人家写在网页上的server跑
所以不懂得怎麽改她的参数
因此觉得结果怪也无法更改
: : (更重要的是他的output很丑....)
: phylip输出的结果除了output外应该还有一个outtree档案
: 该档案的内容是向量格式(用记事本打开会看到一堆数字)
: 这种向量档可以用treeview(直接google应该就找的到)打开
: 通常会比output的图漂亮很多
我要的就是这类 一堆括号又有名字档耶!
这是我比较熟悉的
(treeview可以读的档)
可能是因为我直街用别人网页上写好的server
我没注意到她有这样的档说:P
那我来下载一下phylip好了
谢谢你
: : 因为不常用phylip目前还不知道是什麽问题
: : 想请问各位大大
: : 除了neighbor之外还有没有什麽程式可以做呢?
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