作者fc01 ()
看板BioMedInfo
标题Re: [工具] 有没有程式可以从distance matrix作tree
时间Thu Jun 12 12:02:27 2008
※ 引述《afra33 (豆豆)》之铭言:
: 现在手上已经有distance matrix了
: 不知道有没有什麽程式可以从distance matrix
: 去做出phylogeny tree?
如果不想花钱的话可以用MEGA4(但是免费软体目前大多数paper还是以phylip为主流)
如果愿意花100美金的话.那乾脆去弄一套PAUP....
: 我试过phylip的 NEIGHBOR
: 不过...她的结果我觉得有点奇怪,
何谓结果奇怪,也许是你有东西设错?
: (更重要的是他的output很丑....)
phylip输出的结果除了output外应该还有一个outtree档案
该档案的内容是向量格式(用记事本打开会看到一堆数字)
这种向量档可以用treeview(直接google应该就找的到)打开
通常会比output的图漂亮很多
: 因为不常用phylip目前还不知道是什麽问题
: 想请问各位大大
: 除了neighbor之外还有没有什麽程式可以做呢?
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.84.219