作者vyvyan (忙碌 是为了将来)
看板Agronomy-89
标题[情报] 生物资讯与计算分子生物学的报告写法
时间Tue Sep 23 14:51:09 2003
※ [本文转录自 NTUcourse 看板]
作者: vyvyan (忙碌 是为了将来) 看板: NTUcourse
标题: [情报] 生物资讯与计算分子生物学的报告写法
时间: Tue Sep 23 14:50:56 2003
1.进入NCBI的网页
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
在Search栏点选 "Nucleotide" 并在右方key 入你选取的gene名称
老师的范例是"stk6"
输入後按确定
选一个"人类"的基因有关选项
若有两个以上就选择最完整的那个
老师的范例是选择第二项
点选进去後
将 LOCUS DEFINITION DNA序列 Protein序列复制下来
2.同样在NCBI的网站
在Search栏点选 "UniGene" 并在右方key 入你选取的gene名称
同样也是找寻和人类基因有关的选项
老师的范例是选2
将出来的画面print下来
作为第二张投影片
标题为"SELECTED MODEL ORGANISM PROTEIN SIMILARITIES"
3.同样在NCBI的网站
在Search栏点选 "OMIM" 并在右方key 入你选取的gene名称
Print出来的画面
4.接上例3.
点取出现网页上方有关基因在染色体上的位置连结
找到你的目标基因 点选进去
Print 这个画面
5.进入GeneCard的网站
http://bioinformatics.weizmann.ac.il/cards/
输入你的基因名称
画面出来後 点选你的目标基因说明左方的 "Display the complete GeneCard"
Print出来的画面
6.接5.的例题
应可以上同一画面里找到"gene ontology"的连结
点进去
看到"What is gene ontology?"的连结
老师说要点进去看一看
7.同样接5.的例题
在同一画面找到"Swiss-Prot"的连结
点选右上方 "Prosite"的连结
进去後 在下方一点的空格填入你的基因名称(蓝色背景的部分)
Print出来的画面
(这一个我觉得怪怪的...大家先自己看看...)
8.进入KEGG的网站
http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg2.html
输入你的pathway
并print下来那个pathway的图
9.进入Biocarta的网页
http://cgap.nci.nih.gov/Pathways/Pathway_Searcher
输入你的pathway
print下来那个pathway的图
10. 进入SMD的网站
http://genome-www5.stanford.edu//
点选左方S.O.U.R.C.E的连结
输入你的目标基因
Print画面
11.接上例10.
在同一个画面内找到"Show Gene Expression Data"
点进去
选NCI60的连结进去
把出来的画面下面那一条黑黑的蛋白质序列点开
会有一大片图出来
把整页print下来
这次的报告要做这11面的powerpoint...
下下礼拜二上课之前交....
ps..凡受用这篇文章的同胞们
要在心中大喊"Miss Lu 同学~~~谢谢你~~~" ^^"
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打的很辛苦ㄋㄟ....^^"
大家要记得写报告唷~~~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.csie.ntu.edu.tw)
◆ From: 140.112.74.143
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1F:→ coccuslovely:miss lu好利害啊!!!爱死你了!!!*^^* 推 210.85.63.134 09/24
2F:→ Hsaug:miss lu 感谢你 这堂课有你真好 推 140.112.228.19 09/24