作者EnagoTW (Enago)
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标题[分享] PubChem化学文献搜索引擎
时间Mon Jan 20 15:44:18 2014
http://ppt.cc/sina
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2004年开张的
PubChem (
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)是专门针对查询化学分子与生物活性的搜索引擎,系统由隶属美国国立卫生研究院(NIH)的国家生物技术资讯中心(NCBI)维护,拥有上百万组化学结构和相关文字资料,并可免费经由FTP下载。
图:
http://ppt.cc/p5CO
从网页编排便可得知,PubChem主要有Compound、Substance、BioAssay3种资料库:
* Compound包含结构已知且少於1000个原子和1000个化学键的小分子化合物
* Substance除了纯化合物外,还包含混合物、萃取物、络合物以及结构未定的物质
* BioAssay包含1644项高通量筛选计画的生物活性数据
PubChem除了有与PubMed相似的文字搜索功能(请参考「
PubMed期刊论文搜寻引擎 (
http://ppt.cc/AAMJ)」),还提供多种符合化学研究者需求的贴心搜索功能,例如化学结构、名称片段、化学式、分子量、脂水分配系数、氢键给体和受体数等,除此之外,还可线上画结构或片段来作搜寻,并有CID, SMILES, InChI系统可输入和输出所有常用化学档案格式。
而每笔搜寻结果包含同义字、化学特性、化学结构、生物活性、相关化学结构、其他NCBI数据库(例如PubMed)的网页连结等有用资讯。
PubChem目前是化学界学者熟知的美国化学学会(ACS)化学文摘服务搜索系统(cas.org)的最大竞争对手。
参考资料:
1. PubChem化学文献搜索引擎
2. Wikipedia: PubChem
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